近期单细胞研究进展一览

皮肤病专业医院 http://m.39.net/pf/a_4322694.html
点击上方“转化医学网”订阅我们！干货

靠谱

实用 　　细胞是生物学的基本单位，研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降，破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。 　　《NatureMethods》整理了年最值得 　　目前，最常见的单细胞测序的应用是在肿瘤研究和生殖研究上。下面让我们看一看今年在单细胞研究领域都有哪些进展。1单细胞分析揭示lncRNA的秘密 　　加州大学研究团队在人类新皮层的发育过程中，对长非编码RNA（lncRNA）进行了单细胞分析。他们在4月14日的GenomeBiology杂志上发表文章指出，lncRNA在新皮层特定细胞中起到了重要的作用。该杂志还同时刊发了华裔牛人HowardY.Chang为这项研究成果撰写的点评。（原文：Single-cellanalysisoflongnon-codingRNAsinthedevelopinghumanneocortex;Single-cellprofilingoflncRNAsinthedevelopinghumanbrain）2Nature综述：单细胞测序之现状 　　单细胞基因组学领域近年来发展得非常迅速，为人们揭示了复杂生物学体系的许多重要线索，包括微生物群落的生态多样性和人类癌症的基因组。1月25日NatureReviewsGenetics杂志发表的一篇重要综述，全面介绍了单细胞基因组测序的发展现状。文章的通讯作者是著名科学家、斯坦福大学生物工程系主任StephenR.Quake。这篇文章首先探讨了单细胞基因组测序面临的技术挑战，随后介绍了一些技术进步带来的生物学新发现。重点 　　近期在《NatureImmunology》发表的一项新研究，详细检测了一组新发现的免疫细胞（被称为ILC）。通过对单个扁桃体细胞的基因表达进行分析，瑞典卡罗林斯卡学院的科学家们，发现了三个以前未知的ILC子群，并揭示了关于“这些细胞在人体中如何发挥功能”的更多信息。在这项研究中，该团队使用了一种新的方法，可使他们分选单个扁桃体细胞，并测量成千上万个基因的表达。这样，研究人员就可以设法将数百个细胞，一个接一个地进行分类，以定义存在于人类扁桃体中的ILCs类型。（原文：TheheterogeneityofhumanCD+innatelymphoidcellsrevealedbysingle-cellRNAsequencing）4测序黑马10XGenomics推出单细胞测序产品 　　10XGenomics的CEOSergeSaxonov近日在摩根大通保健大会（JPMorganHealthcareConference）表示，他们已售出43台仪器。另外，公司计划推出第2版的仪器，与Illumina的HiSeqXTen系统兼容。同时，他们针对GemCode平台推出了文库制备试剂盒，适用于单细胞RNA测序。据Saxonov介绍，他们采用了一种称为GEM的核心技术。从本质上讲，DNA上样到GemCode系统后，分子被分液、片段化，并加上一种合成寡核苷酸的条形码。在不到五分钟的时间内，超过万个GEM（凝胶珠）形成。测序之后，利用计算机算法可将带有相同条形码的短序列可以再次连接，形成原先的DNA长分子。5单细胞测序为研究免疫反应提供新方法 　　欧洲分子生物学实验室等机构的研究人员近日开发出一种计算方法，能够从单个T细胞的RNA测序数据中重建配对的T细胞受体（TCR）序列，将T细胞特异性与功能反应相关联。这款工具名为TraCeR。它能将测序读取组装成连续序列，以寻找全长的TCR重组序列。重要的是，重建的重组序列包含几乎全长的V(D)J区域，让研究人员能够自信区分相近的基因片段。研究人员认为，这种方法灵敏、准确，容易适应，下一步将应用于B细胞。不过，目前研究整个免疫组库的成本太高，随着单细胞RNA测序的通量增高，成本降低，这可能会发生改变。（原文：Tcellfateandclonalityinferencefromsingle-celltranscriptomes）6CellStemCell发表单细胞RNA测序新成果 　　3月4日，JohnsHopkins大学的宋红军（HongjunSong）和明国丽（Guo-liMing）在寨卡病毒研究中获得了突破性的成果。他们在CellStemCell杂志上发表文章指出，寨卡病毒能感染形成大脑皮层的神经干细胞，阻碍这些细胞的生长。研究显示，涉及细胞分裂的AXL在神经干细胞的表面高水平表达。表达AXL的神经干细胞只存在于妊娠中期，这些细胞称为放射状胶质细胞，能生成大脑皮层中的多种细胞，包括神经元和星形胶质细胞。除此之外，视网膜干细胞也表达AXL。寨卡病毒感染会使胎儿出现小头畸形和眼部病变，这些症状与AXL细胞的分布相当一致。（原文：ExpressionAnalysisHighlightsAXLasaCandidateZikaVirusEntryReceptor）7单细胞分析解释印记相关疾病 　　人体中的每个细胞都有两套基因组，一套来自母亲，一套来自父亲。然而，研究人员目前仍不清楚每套基因组的具体表达情况。为此，美国宾夕法尼亚大学的研究人员开发出一种新技术，并用它来研究罕见病。研究小组以小鼠为模型，比较了正常小鼠和Russell-Silver综合征小鼠的基因组。在细胞群体水平，Russell-Silver小鼠表达母本和父本的H19。之后，他们利用一种分子探针来检测母本和父本之间RNA的单核苷酸变化。这种方法测定了单细胞中特异的变异表达。研究人员表示，这是第一次在单细胞水平证明了表观遗传嵌合体的存在。研究结果表明，印记疾病可能表现出惊人的单细胞异质性，而这种异质性可能解释了表观遗传嵌合体的存在。（原文：Visualizingallele-specificexpressioninsinglecellsrevealsepigeneticmosaicisminanH19loss-of-imprintingmutant）8Cell子刊：单细胞技术让癌症无路可走 　　加州理工的研究团队日前通过单细胞分析，全面绘制了癌细胞迂回前进的路线。研究显示，单细胞磷酸化蛋白质组学技术能够反映单个癌细胞的内部活动和信号传导。“我们看到了癌细胞生长的其他路径，可以想办法把它们全部堵死，”这篇文章的通讯作者，加州理工的JamesHeath说。研究指出，在我们发现任何临床改变之前，胶质母细胞瘤就开始重新选择生长路径，想办法规避抗癌药物的作用。单细胞磷酸化蛋白质组学技术可以帮助人们开发更有效的胶质母细胞瘤联合疗法。该技术对其他癌症的个性化治疗也很有意义，比如分析黑色素瘤细胞对BRAF抑制剂的抵抗。（原文：Singlecellphosphoproteomicsresolvesadaptivesignalingdynamicsandinformstargeted 　　近日，全球首例接受无创胚胎染色体筛查（NICS）的试管婴儿于无锡市妇幼保健院生殖中心健康诞生。此次的NICS技术在保持高准确度的同时，对样本的提取手段进行了革新，即从传统的活检取材变为培养液采集。这使得样本提取更易操作，也更有助于该类筛查在更多的生殖中心普及和应用，造福更多有需要的中国家庭。而NICS技术的研发人员正是利用了这些游离在培养液中极微量的DNA,通过目前全球领先的单细胞全基因组扩增技术---MALBAC，实现对胚胎染色体的全面筛查。End长期招募转化医学网长期招募兼职生物医学编辑；在校硕士、博士生为佳；有兴趣可加d。转折点APP核心亮点：免费、高效、搞得定！点击“阅读原文”，下载转折点APP！预览时标签不可点收录于话题#个上一篇下一篇